日本からセブへはフィリピン航空が週5便の直行便（東京のみ）を運航しており、所要時間はおよそ４時間３０分です。日本の他都市からは、マニラで国内線へ乗り継ぎが必要になりますが、マニラ−セブ間には最大１８便／日が運航していますので、日本を出発したその日にセブに到着することも出来ます。また、韓国や香港を経由してセブにいらっしゃる方も、多くいます。
マニラには、ターミナル１（フィリピン航空以外の国際便）、ターミナル２（フィリピン航空の国際／国内便）、ターミナル３（セブ・パシフィック航空の国際／国内便、ＰＡＬエクスプレス、エアフィリピン）の３つがあります。マニラにて国内線に乗り継ぎが必要な方は、航空会社によりターミナルが異なりますので十分注意が必要です。また、各ターミナル間の移動には、一般的にタクシーを利用しますので乗り継ぎ時間を十分考慮する必要がありますのでご注意ください。
１．フィリピン航空（国際線）ターミナル２→フィリピン航空（国内線）ターミナル２への乗り継ぎ
フィリピン航空の国際／国際線ともにターミナル２となりますので、到着後乗り継ぎカウンターにてセブ行き搭乗券を取得し、入国手続き→税関チェック→国内線出発ロビー（同ビル２階）へ移動します。日本出発時に預けた手荷物は、セブ到着後に引渡しとなります。
※便により、国内空港に移動となりますのでご注意ください。
２．フィリピン航空（国際線）ターミナル２→セブパシフィック／エアーフィリピン／ＰＡＬエクスプレス（国内線）マニラ国内空港への乗り継ぎ
ターミナル２からターミナル３への移動が必要になります。日本から到着後、入国手続き→税関チェック→ターミナル３へ移動→国内線搭乗手続き、となります。
※ターミナル２→ターミナル３への移動には、車で最低約３０分は必要ですのでご注意ください。
３．日本航空・ノースウェスト航空（国際線）ターミナル１→フィリピン航空（国内線）ターミナル２への乗り継ぎ
ターミナル１からターミナル２への移動が必要になります。日本から到着後、入国手続き→税関チェック→ターミナル２へ移動→国内線搭乗手続き、となります。
※ターミナル１からターミナル２は、車で最低約３０分は必要ですのでご注意ください。
４．日本航空・ノースウェスト航空（国際線）ターミナル１→セブパシフィック航空（国内／国際線）／エアーフィリピン／ＰＡＬエクスプレス（国内線）ターミナル３へ乗り継ぎ
ターミナル１からターミナル３への移動が必要になります。日本から到着後、入国手続き→税関チェック→マニラ国内空港へ移動→国内線搭乗手続き、となります。
※ターミナル１からターミナル３は、車で約４０分は必要ですのでご注意ください。
※2010年1月20日現在のスケジュールです。
| 東京（成田）⇔セブ （直行便） |  |
|---|
路線 |
便名 |
出発 |
到着 |
航空会社 |
運航日 |
東京（成田）→セブ |
PR-433 |
14:25 |
18:50 |
フィリピン航空（PAL) |
火/水/木/金/土/日 |
路線 |
便名 |
出発 |
到着 |
航空会社 |
運航日 |
セブ→東京（成田） |
PR-434 |
08:00 |
13:25 |
フィリピン航空
（PAL) |
火/we/木/金/土/日 |
| 大阪（関西） ⇔ セブ （直行便） |
|---|
路線 |
便名 |
出発 |
到着 |
航空会社 |
運航日 |
大阪（関西）→セブ |
現在、運航休止中 |
路線 |
便名 |
出発 |
到着 |
航空会社 |
運航日 |
セブ→大阪（関西） |
現在、運航休止中 |
| 東京（成田）⇔マニラ (直行便） |   |
|---|
路線 |
便名 |
出発 |
到着 |
航空会社 |
運航日 |
東京（成田)→マニラ |
PR-431 |
09:30 |
13:10 |
フィリピン航空（PAL) |
毎日 |
JL-741 |
09:30 |
13:05 |
日本航空（JAL) |
毎日 |
|
JL-745 |
18:20 |
21:55 |
日本航空（JAL) |
毎日 |
|
NW19 |
19:30 |
23:10 |
ノースウェスト航空（NW) |
毎日 |
路線 |
便名 |
出発 |
到着 |
航空会社 |
運航日 |
マニラ→東京(成田） |
NW-20 |
08：00 |
13:30 |
ノースウェスト航空（NW) |
毎日 |
JL-746 |
09:00 |
14:25 |
日本航空（JAL) |
毎日 |
|
JL-742 |
14:25 |
19:50 |
日本航空（JAL) |
毎日 |
|
PR-432 |
14:55 |
20:10 |
フィリピン航空（PAL) |
毎日 |
| 大阪（関西）⇔マニラ | |
 |
|---|
路線 |
便名 |
出発 |
到着 |
航空会社 |
運航日 |
大阪(関西)→マニラ |
PR-407 |
09:55 |
13:30 |
フィリピン航空（PAL) |
毎日 |
５J827 |
19:20 |
22:30 |
セブパシフィック航空(CEB） |
火／木／日 |
路線 |
便名 |
出発 |
到着 |
航空会社 |
運航日 |
マニラ→大阪（関西） |
5J828 |
14:00 |
18:35 |
セブパシフィック航空(CEB） |
火／木／日
|
PR-408 |
14:20 |
19:05 |
フィリピン航空（PAL) |
毎日 |
| 名古屋(中部）⇔マニラ | |
|---|
路線 |
便名 |
出発 |
到着 |
航空会社 |
運航日 |
名古屋（中部） → マニラ |
PR-437 |
09:30 |
13:00 |
フィリピン航空（PAL) |
毎日 |
NW-71 |
19:45 |
22:40 |
ノースウェスト航空（NW) |
毎日 |
路線 |
便名 |
出発 |
到着 |
航空会社 |
運航日 |
マニラ→名古屋（中部） |
NW-72 |
06:45 |
11:45 |
ノースウェスト航空（NW) |
毎日 |
PR-438 |
13:35 |
18:20 |
フィリピン航空
（PAL) |
毎日 |
| 福岡⇔マニラ | |
|---|
路線 |
便名 |
出発 |
到着 |
航空会社 |
運航日 |
福岡→マニラ |
PR-425 |
15:35 |
18:20 |
フィリピン航空
（PAL) |
月/木/金/土/日 |
路線 |
便名 |
出発 |
到着 |
航空会社 |
運航日 |
マニラ→福岡 |
PR-426 |
10:15 |
14:35 |
フィリピン航空
（PAL) |
月/木/金/土/日 |
